KRAS-geenin mutaatiot G12A/C/D/R/S/V ja G13D, solunulkoinen DNA

Johdanto

Tutkimuksessa analysoidaan KRAS-geenin G12A/C/D/R/S/V ja G13D -mutaatio solunulkoisesta (cell free) DNA:sta. 

Tiedustelut

Fimlabin asiakaspalvelu puh. 020 785 1000

Indikaatiot

Syövän molekyyligeneettinen seuranta.

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Tilataan tutkimusnumerolla: 27149 B -KRAS-fD (verinäyte, Streck-putki). 

Tilattaessa verinäytteestä tehtävää  B -KRAS-fD tutkimusta, valitaan WebFimlabissa Näytteenotto -kohtaan "Näytteenotto laboratoriossa", kuten muitakin verinäytteistä tehtäviä tutkimuksia tilattaessa. 

Näytteenotto tapahtuu kuitenkin "Streck erikoisputkiin", joita ei ole saatavilla kaikissa näytteenottopisteissä. Tästä syystä B -KRAS-fD -tutkimuksen näytteenotto on keskitetty keskussairaaloiden näytteenottopisteisiin, missä Streck-putkia on saatavilla. 

Pyyntöön merkitään näytteenottoindikaatio, kysymyksenasettelu sekä keskeiset tiedot anamneesista.

Näyteastia

10 ml Streck-putki (Cell-free DNA BCT CE, Streck).

Tyhjät näytteenottoputket tulee säilyttää huoneenlämmössä. Putket eivät saa jäätyä.

Näyte

2 x 10 ml kokoverta Streck-putkeen. Ehdoton minimimäärä 7 ml / putki.

Jos samassa yhteydessä otetaan muita näytteitä, ennen BCT-putkea suositellaan otettavaksi EDTA-veriputki. Glykolyyttisiä inhibiittoreita sisältävät putket (fluoridioksalaatti)  (glukoosi- ja laktaattiputket) otetaan vasta BCT-putkien jälkeen.

Liimaa tulostettu tarra Streck-putkiin. Näytteenoton jälkeen putket sekoitetaan kääntelemällä putkia ympäri vähintään 10 kertaa tai asettamalla putket sekoittajaan. Ei saa ravistaa!

Streck -putkia ei saa lähettää putkipostilla; hemolyysi.

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näyte säilytetään ja kuljetetaan huoneenlämmössä. Näyte EI SAA jäätyä!

Menetelmä

Solunulkoisen DNA:n eristys sekä alleelispesifinen ddPCR-menetelmä. Menetelmällä voidaan osoittaa seitsemän yleisintä KRAS-geenin aktivoivaa mutaatiota (p.Gly12Asp, p.Gly12Val, p.Gly12Cys, p.Gly12Ala, p.Gly12Ser, p.Gly12Arg, p.Gly13Asp), mutta tutkimus ei erottele näitä toisistaan. Mikäli KRAS mutaatio p.Gly12Cys (p.G12C) halutaan määrittää erikseen, tulee se mainita lähetteessä.

Tulos valmiina

Tulos on valmiina kahden viikon kuluessa.

Tulkinta

Tutkimuksesta annetaan lausunto. 

Lisätiedot

Tutkimus tehdään alihankintana.